La jacinthe d'eau est devenue l'un des fléaux le plus important pour les étendues d’eau douce des tropiques dans les régions où elle a été introduite, rivières et lacs. En l’absence de ses prédateurs naturels tel que le lamantin, la jacinthe d’eau devient

 très invasive. Sa croissance rapide lui permet d’occuper des plans d’eau en un temps relativement court, en créant au-dessus de ce plan d’eau une nappe verte qui empêche aux rayons du soleil d’atteindre la surface. Ces tapis mono-spécifiques denses réduisent pendant la nuit, le niveau d'oxygène de l'eau à un niveau insupportable pour de nombreuses espèces.

A cause du manque de lumière et d’oxygène que son expansion provoque, la présence de la jacinthe d’eau entraine la modification de l’écosystème du plan d’eau par la diminution de la vie aquatique.

Sa capacité d’épuration se trouve aussi anéantie par le fait qu’elle absorbe les polluants des eaux usées, mais empêche la désinfection naturelle de l’eau par les UV et participe ainsi au changement de la nature des sédiments.

Sa contribution aux activités agricoles est devenue problématique dans la mesure où son utilisation comme compost entraine l’alcalinisation des surfaces agraires. Elle entraine la modification des sols où elle est utilisée en entrainant la valeur du PH > 9.

Sa propension à étouffer les plans d’eau rend toute circulation maritime impossible, et affecte négativement les techniques d’irrigation.